| Algyő-Tápé-Körös-éri |
| Alsó-Duna jobb part |
| Alsó-Nyírség |
| Bajai |
| Balaton déli |
| Balaton északi |
| Balaton-északi |
| Beregi |
| Berettyó-Sebes Körös |
| Bodrog jobb part -Zempléni |
| Bodrogzug-Törökéri |
| Bölcske-Bogyiszlói |
| Börzsöny-Kosdi-Pesti |
| Bükk és Borsodi-Mezőség |
| Cserhát |
| Dong-ér-Kecskeméti |
| Dong-éri |
| Dráva menti |
| Dél-Mezőföld |
| Felsőszabolcsi |
| Fertő-Hanság |
| Gerecse-Tétény-Észak-Mezőföldi |
| Gyáli |
| Gödöllő-Nagykátai |
| Hajdúhátság |
| Hernád |
| Homokhátsági vízhiány-védelmi körzet |
| Inérhát-Tiszadobi |
| Ipoly |
| Jászsági vízhiány-védelmi körzet |
| Kalocsai |
| Kapos-Koppány felső |
| Kapos-Koppány-alsó |
| Kelet-Dunazug |
| Kelet-Mezőföldi (Dél) |
| Kelet-Mezőföldi (Észak) |
| Keleti-Bakony |
| Kettős-Sebes Körös közi (dél) |
| Kettős-Sebes Körös közi (észak) |
| Kis-Balaton |
| Kis-Koppány |
| Komáromi |
| Kraszna balparti |
| Kunszentmiklósi |
| Kurcai |
| Közép-Mezőföld |
| Laskó-Csincse |
| Marcal-medence |
| Marcal-medence jobb part |
| Mura |
| Mártély-Tisza-Maroszugi |
| Nagykunsági vízhiány-védelmi körzet |
| Nyírségi |
| Prügy-Taktaföldvári |
| Rigós-Sajózug |
| Rinya-mente |
| Rába |
| Sajó Bódvával |
| Sió alsó (Tolnai) |
| Sió felső |
| Soproni |
| Szamos-Krasznaközi |
| Szarvasi |
| Szeghalmi |
| Szekszárd-Bátai |
| Szerencs-Takta |
| Szigetköz |
| Sámson-Élővízi |
| Tarna völgy |
| Tisza közvetlen |
| Tisza-Szamos közi |
| Tiszakarád-Ricsei |
| Tiszalöki öntözőrendszer (TÖR) |
| Tiszavalk-Sulymosi |
| Torontáli |
| Velencei-tó |
| Vidre-éri |
| Zagyvai vízhiány-védelmi körzet |
| Zala |
| Élővízcsatorna |
| Érd-Adony-Ráckevei |
| Észak-Bakony-Pannonhalmi |
| Észak-Duna-völgyi |